各種動物的排泄物是常見的有機肥料，如家禽、牛、豬、羊等動物之排泄物，包括固態及液態兩類，排泄物的類別及營養含量除不同於動物而有較大差異外，飼料及消化能力的不同， 也是重要的影響因子，一般雞糞含有較高的氮氣，豬糞則常見含有比牛糞多的磷素。動物的排泄物中固體及液 體（尿水）均可分開處理或與吸收材料（植物體或吸附料）混合處理供廄肥使用。台灣走向企業化經營養豬養雞， 這些動物糞便處理應用值得重視。

　　作物殘體可做廄肥、堆肥或留在田間當有機肥，雖然作物殘體所含養分不高，但主要是可改善土壤的構造，及分解時產生許多有機酸，對土壤營養成分之有效性有增進的效果，尤其對 微量元素之供應有其重要性。

　　堆肥是動植物體之廢棄物經堆置及部分分解的產物，由於質材來源種類甚多，甚至垃圾都可做堆肥，一些對製作堆肥的基本瞭解是必須的：

1. 堆肥的施用目的是增進土壤有機質及生長促進劑，以便維持土壤地方， 尤其對土壤物理性、化學性及生物均甚有助益。
2. 有機物的分解是靠微生物進行的，因此製造堆肥的環境要適合微生物活動的條件，例如有充分的濕度及通氣。在生產過程中需要經堆積及翻轉的步驟，也需要足夠的氮素提供微生物之繁殖。為了使堆積有更好的開始，可利用腐熟堆肥或微生物接種劑加速堆肥之形成分解時堆肥能產主高溫， 有助殺死病菌，因此堆肥外覆蓋以增加溫度也是有用的方法。
3. 添加礦物質及其他有機質可加速堆肥腐熟之功效，尤其是氮素類的有機質(豆類粉及酵母粉)的添加，對「碳氮比」高的堆肥質料最有效，常施用 0.l～1 % 之量。石灰質材可減少酸性發生，例如石灰石粉常見施用 0.3-0.5% 量，有助堆肥之品質。
4. 土壤動物也是常被考慮有加速有機質分解的效用，但實際應用較少。